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Améliorer le génome et le phytozome du cacao

Selon l’Organisation internationale du cacao (ICCO), la production mondiale de fèves de cacao en 2017-2018 était de 4,6 millions de tonnes. Les marques mondiales de chocolat ne pourraient pas exister sans cacao. Mais aujourd’hui, la plante est menacée par le changement climatique et les infections fongiques dévastatrices. C’est pourquoi Mars, Inc., fabricant de chocolat depuis plus de 100 ans et l’un des plus importants acheteurs de cacao au monde, collabore avec d’autres pour développer des plants de cacao plus sains et plus productifs pour garantir la production de cacao pour le chocolat de demain.

En 2010, un projet de premier génome de Theobroma cacao – l’arbre qui produit les fèves de cacao – a été publié par un consortium dirigé par Mars, Inc. dans le cadre du projet Cacao Genome Database. La séquence du génome a été assemblée par l’équipe chargée des plantes à l’Institut HudsonAlpha de biotechnologie.

Un génome de référence mis à jour pour T. cacao a été achevé et publié par les scientifiques d’HudsonAlpha grâce au financement de Mars Wrigley. Le génome annoté a été mis à jour selon un standard moderne de haute qualité et comprend des données d’ARN-seq. L’un des objectifs de la mise à jour de l’annotation du génome était de développer un nœud de haute qualité pour le cacao utilisé en orthologie systémique afin de permettre son utilisation à la fois pour la biologie fonctionnelle et la sélection du cacao.

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